La línea de conexión desde el Linac2 al PSB tiene una longitud de 80m. 20 cuadrupolos magnéticos focalizan el haz de protones y otros 10 imanes lo curvan y dirigen, tardando menos de un microsegundo en ser inyectados en el acelerador circular de 628 m Proton Synchrotron (PS) donde serán acelerados hasta los 25 GeV.
En el PS los protones pueden o ser acelerados/manipulados/extraidos en 1025 ms, o esperar 1.2 segundos más antes de ser acelerados si forman parte del primer paquete inyectado desde el PSB.
Después son enviados al acelerador circular de 7 km Super Proton Synchrotron (SPS) donde esperarán 10.8, 7.2, 3.6, o cero segundos si forman parte del primer segundo, tercer, o cuarto paquete inyectado desde el PS al SPS. El SPS los acelera hasta 450 GeV en 4.3 segundos, y los envía al LHC.
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Los dos haces de partículas permanecen en el colisionador, a máxima enerxía, unas 10 horas , es el llamado "beam lifetime" (tiempo de vida del haz). En ese tiempo, los protones habrán realizado cuatrocientos millones de revoluciones dentro de la máquina.
En cada vuelta, un cierto número de protones son perdidos. Esto es debido a la eficacia limitada de los sistemas magnéticos que controlan los haces, interacción con las moléculas del gas residual en los tubos de vacío, interacción culombiana con los protones que vienen en sentido contrario en las zonas de colisión, son algunas de las razones de estas pérdidas de partículas del haz. Además, se produce la interacción, también culombiana, entre los protones que forman los paquetes (bunches) que conforman el haz. Como los protones oscilan ligeramente alrededor de su trayectoria circular, pueden entrar en contacto con otros protones del mismo paquete, pudiendo haber modificaciones en sus momentos lineales que provocan su inestabilidad. Los sistemas multipolares magnéticos no podrán corregir esos cambios, generándose la pérdida de esas partículas en el tubo de vacío. Esto es lo que se conoce como efecto Touschek, en honor al físico austríaco Bruno Touschek.
Estos movimientos caóticos pueden llegar al extremo de descontrolar el haz, lo que provocaría trasferencia de energía sobre el sistema criogénico que implicaría la pérdida de las condiciones de superconductividad (quenching), lo que tendría muy negativas consecuencias. Por ello, vaciar los tubos (dumping) se hacer necesario, para inyectar desde el SPS una nueva colección de paquetes en el LHC.
Así que después de 10 h de colisiones, el haz de partículas debe ser extraído. El campo magnético de los dipolos magnéticos baja hasta los 0.54 T, permaneciendo así entre 20–40 min. En este período de tiempo el proceso de inyección es repetido y los dipolos vuelven a alcanzar los 8.3 T para iniciarse otro ciclo de colisiones a alta energía. La máquina está diseñada para soportar unos 20000 ciclos de este tipo en 20 anos de vida útil, y además entre 20–30 ciclos térmicos.
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